临床显示：服用二代靶向药阿法替尼可能出现的副作用与一代靶向药物(厄洛替尼、吉非替尼)比较要略大一些。但是对于服用阿法替尼副作用比较大的患者，只需要将服用剂量由40毫克降至30毫克，其产生的副作用基本达到和第一代药物等同的水平，且疗效没有下降。
(1)腹泻：腹泻可能导致脱水和肾衰。阿法替尼规格对严重和对抗腹泻药物无反应延长腹泻不给阿法替尼。
(2)大疱和剥脱性皮肤疾病：阿法替尼片说明书0.15%患者中生严重大疱，起泡，和去角质病变。对威胁生命的皮肤反应终止阿法替尼。对严重和延长皮肤反应不给阿法替尼。
(3)间质性肺病(ILD)：在1.5%阿法替尼患者发生。对肺症状急性发作或恶化不给阿法替尼。如被诊断ILD终止阿法替尼。
(4)肝毒性：在0.18%阿法替尼患者中发生致命性肝损伤。用定期肝检验监视。对肝检验严重或恶化不给或终止阿法替尼。
(5)角膜炎：在0.8%阿法替尼患者中发生。
(6)阿法替尼胚胎胎儿毒性：可致胎儿危害。劝告女性对胎儿潜在危害和使用高效避孕。
因此，在肺癌患者使用阿法替尼的过程中建议对患者做好护理，通过减量，对症治疗等方法，以上这些副作用大多可以迎刃而解。
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