使用TAF治疗乙肝后，可能出现乳酸酸中毒/有脂肪变性的严重肝肿大、治疗终止后乙肝严重急性加重以及新发作或恶化的肾受损等较为严重的不良反应。
核苷酸类似物的使用，包括替诺福韦脂与其他抗病毒药物联用，曾报道有乳酸酸中毒和有脂肪变性的严重肝肿大，包括致命性的病例。这些病例多数为妇女、肥胖、或者能够延长核苷暴露的风险因子。
在任何患者发生临床或实验室提示性的乳酸酸中毒或明显肝毒性（包括肝脏肿大和脂肪变性或转氨酶严重升高）应该暂停使用TAF。
在接受TAF治疗，终止服用药物后，有可能会出现乙型肝炎的严重急性加重。终止TAF治疗的患者应该严密监测临床和实验室两方面的情况至少几个月，如果有需要，可能需要恢复抗-乙型肝炎治疗。
曾报道在使用TDF后，患者出现肾受损的情况，包括急性肾衰和fanconi综合症（肾小管受损与严重的低磷血症）。TAF临床中未发生。
建议在开始治疗和治疗期间，应该评估患者的血清肌酐、血清磷、肌酐清除率、尿糖和尿蛋白的水平。在发生肾功能减低或Fanconi综合症的患者终止治疗。
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