胃肠间质瘤在过去常常被忽视或者误诊，因为发生位置多在胃或者小肠，也有部分发生在食管等位置，因为未知的特殊常常和其他的恶性肿瘤混合，所以造成误诊。误诊就意味着用药错误，所以产业会出现治疗效果不佳的情况，但是随着近十年医疗的不断发展人们对胃肠间质瘤的认识越来越清晰，治疗效果也有着明显的提升，如果能够早期发现，是能够实现治愈的。
胃肠间质瘤的在人体上的表现并不过分反常，所以常常不能够在早期及时发现，再加上如果病灶肿瘤小于两厘米，可能一点不适都不会发生，所以一经发现基本都是中晚期了。如果早期会产生表现的话，基本都是消化道出血、腹痛、腹块、贫血。部分患者可能出现肠梗阻症状。很多悲者都是在肿瘤普查、体检或其他手术时无意中发现得了此影像学检查对胃肠道间质瘤的诊断具有重要意义，目前的诊断主要依靠纤维内镜，内镜超声、B超和CT等。
出现下面情况的时候，患者要特别警惕。一且出现消化道出血，包括呕血、便血或黑便等症状，以及腹部发现包块、经常出现不明原因的腹痛或难以用其他原因解释的贫血时，都应该及时到正规医院就诊，必要时进行超声内镜检查，如果在胃镜检查中没有发现病灶，最好再进行小肠镜检查，以免漏诊。
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