艾曲波帕作为治疗血小板减少症的重要药物，一直以来在医疗界都发挥着重要的作用，然而，是药三分毒，艾曲波帕也一样。患者在服用药物的时候不仅要注意服用的剂量，也要了解药物的副作用带来的影响，在治疗的过程中有一定的心理准备。
艾曲波帕最常见不良反应是：恶心、呕吐、月经过多、肌肉痛、感觉异常、白内障、消化不良、瘀斑、血小板减少、ALT/AST增加和结膜出血。艾曲波帕常见副作用包括头痛（10％），腹泻（9％），肌肉酸痛（5-12％），恶心（4-9％）和疲倦。
服用艾曲波帕期间应每2周监测肝功能包括血清丙胺酸转胺酶（ALT或GPT），天门冬胺酸转胺酶（AST或GOT）和胆红素，剂量稳定后则每月监测一次，对肝功能异常者，则需每周监测直到肝功能稳定或回到正常值。
服用艾曲波帕还会引起肝毒性，患者需定期查肝功能，且本身肝功受损患者，不宜用药;还会增加骨髓内网状纤维沉积的发展或进展的风险，多为骨髓纤维化征象，应做好外周血复查监测;中断用药可能导致比治疗前病情更严重，或者是增加其他恶性血液病风险，尤其是MDS，一定要注意血常规监测;过量服用时，血小板计数显著增加，会增加血栓形成或血栓栓塞并发症水平。
在患有血小板减少症和晚期慢性丙型肝炎的患者，最重要的严重副作用是用干扰素和艾曲波帕的药物治疗的肝脏问题和血栓栓塞性并发症。在这些患者中，只有在临床上有适应症时才应使用，然后应密切监测患者。停药后也可能再次出现出血。
但与现有治疗血小板减少症药物比较，艾曲波帕是可以口服给药的治疗血小板减少症的药物，安全性高。如果患者出现了严重的副作用，应立即就医，可以在医生的指导下进行服药，千万不要自作主张的增减或者是停用靶向药物。
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