丙肝基因分型是制订标准治疗方案的重要依据，对我们的治疗策略及治疗效果的预估，都发挥着巨大的作用。
可将HCV分为6个(1~6)主要基因型，各型又由若干亚型(a、b、c)组成，如1a、1b、2a、2b、3a、3b等。基因型分布具有明显地域性，中国大6北方以2a(3)型为主，南方以1b(2)型为主。
HCV不同基因型在不同临床类型丙型肝炎中总体分布不一致。急性肝炎、慢性肝炎的中度及重度、肝炎后肝硬化及原发性肝癌组HCV感染以Ⅱ型为主，呈肝癌>肝硬化>慢性肝炎重度>慢性肝炎中度>急性肝炎。
而谷丙转氨酶轻度升高或正常的慢性肝炎，HCV感染以Ⅲ型为主，提示HCV基因型与丙型肝炎患者临床病情及其严重程度密切相关。6例原发性肝癌均为 HCV-Ⅱ型，表明HCV-Ⅱ型感染可能与肝癌发生有关。
并且最重要的是，除了吉三代意外，其他的比如索非布韦、达卡他韦和吉二代等抗病毒药物，都不能对每个基因型具有很高的疗效，因此我们需要做一个基因分型来看看我们的情况，针对不同的情况，来制定最适合我们的治疗方案，同时还可以对治疗的疗效进行预估。
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