对于复发或转移性GIST，分为下列几种情况，需区别对待： ①未经分子靶向药物治疗，但估计能够完全切除且手术风险不大者，可以考虑手术切除并联合药物治疗。 ②分子靶向药物治疗有效，且肿瘤维持稳定的复发或转移性GIST，估计所有复发转移病灶均可切除的情况下，建议考虑手术切除全部病灶。 ③局限性进展的复发转移性GIST，鉴于分子靶向药物治疗后总体控制满意，仅有单个或少数病灶进展，可以考虑谨慎选择全身情况良好的患者行手术切除。术中将进展病灶切除，并尽可能切除更多的转移灶，完成较满意的减瘤手术。 ④分子靶向药物治疗过程中仍然广泛性进展的复发转移性GIST，原则上不考虑手术治疗。⑤姑息减瘤手术仅限于患者能够耐受手术并预计手术能改善患者生活质量的情况。
伊马替尼标准治疗失败后一般有两种选择： 1、增加伊马替尼剂量，从400mg/天增加至600mg/天； 2、改服用舒尼替尼治疗。 如果患者伊马替尼和舒尼替尼的治疗均失败，可考虑瑞戈非尼治疗。
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