吉二代和吉三代都是用来治疗丙肝的靶向药，靶向药相比动手术更能够在保证患者正常生活的同时改善病情，提高患者生活质量，因此靶向药也被越来越广的应用在治疗中。治疗丙肝的靶向药根据研制时间的先后，他们的称呼有所不同。下面就从治愈率、适用人群、副作用、主要成分等方面对吉二代和吉三代进行区分。
1、治愈率
目前吉二代在治疗丙肝方面的治愈率能够达到95%以上；吉三代的治愈率则能够到达99%。
2、适用人群和主要成分
吉二代不适用于2、3、5型丙肝，其主要成分是索非布韦和雷迪帕韦；吉三代则可以适用于全部基因型的丙肝患者，其主要成分是索非布韦和维帕他韦。也就是说如果患者是丙肝2、3型的患者，那么直接服用吉三代就可以，直接能够弥补吉二代的短处，也就是说吉二代是吉三代的升级版。
3、副作用
吉二代常常伴随着身体劳累、头部疼痛、肠胃不适、恶心呕吐、精神不济等等副作用；吉三代与吉二代相比副作用更小，治疗成本少的同时也让患者更加舒适。
吉三代因为覆盖1-6型所有的丙肝类型，且治愈率高，所以应用更加广泛。目前，吉三代因为生产成本等问题，一个疗程的费用也比较昂贵，所以印度仿制版这种疗效基本一致但是价格更便宜的药物也成为更多患者的首要选择。
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